Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (w/m/d) Bioinformatik
Die im Jahre 1456 gegründete Universität Greifswald gehört zu den ältesten Universitäten im Ostseeraum. Über die Jahrhunderte hinweg hat sie ihren Ruf als Stätte international wirksamer Forschung und hochwertiger Lehre erworben, bewahrt und ausgebaut. Ihre Forschungsstärke bezieht die Universität vor allem aus der intensiven interdisziplinären Zusammenarbeit von fünf Fakultäten einschließlich der Universitätsmedizin und engen Kooperationen mit regionalen, nationalen und internationalen Forschungspartnerinnen und -partnern.
Am Institut für Mathematik und Informatik der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität Greifswald ist vorbehaltlich der Mittelbereitstellung eine Stelle als wissenschaftliche Mitarbeiterin bzw. wissenschaftlicher Mitarbeiter zu besetzen.
Ihre Aufgaben:
- Assembly und Annotation von Phytoplankton-Genomen und Metagenomen
- Weiterentwicklung bioinformatischer Datenanalyse-Pipelines
- Nutzung und Weiterentwicklung von Deep Learning Tools zur Genom- und Proteinannotation
- Integration von Multi-OMICs-Datensätzen
- Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse
- Vorbereitung wissenschaftlicher Publikationen
- Die Stelle bietet die Möglichkeit zur Promotion zu einem Thema im oben genannten Forschungsbereich
Ihr Profil:
- Zum Einstellungszeitpunkt vorliegender Master-Abschluss (oder gleichwertig) in Bioinformatik bzw. Biomathematik oder einer anderen verwandten Disziplin
- Fundierte Kenntnisse im Bereich der bioinformatischen Genomanalyse
- Solide Programmierkenntnisse in Python und Bash (auch ohne Einsatz von KI)
- Erfahrung in stand-alone Softwareentwicklung
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Erwünscht sind:
- Erfahrung mit Deep Learning Frameworks (z. B. TensorFlow)
- Kenntnisse in einer Python-basierten Workflow-Sprache (z. B. Nextflow, Snakemake)
- Erfahrung mit der Analyse großer Datensätze (Next-Generation Sequencing Daten)
- High Performance Computing Kenntnisse (z. B. mit SLURM)
- Kenntnisse in Software-Versionskontrolle (z. B. git)
- Hohe Motivation und überdurchschnittliche Qualifikation, aktiv in einem interdisziplinären Forschungs- und Ausbildungsumfeld zu arbeiten
- Eigenständige Arbeitsweise mit Hands-on-Mentalität, Teamgeist, Hilfsbereitschaft und Zuverlässigkeit
- Interesse an mariner Mikrobiologie und Ökologie
Nähere Informationen zur Bewerbung finden Sie unter:
https://karriere-in-mv.de/stelle/15367-wissenschaftliche-r-mitarbeiter-… (https://karriere-in-mv.de/stelle/15367-wissenschaftliche-r-mitarbeiter-…)